"Akkreditierung" bedeutet das Durchlaufen eines Begutachtungsverfahrens: Im Auftrag der Hochschulen prüfen dazu berechtigte Akkreditierungsagenturen, ob ein Studiengang fachlich-inhaltlich und hinsichtlich seiner Berufsrelevanz bestimmten Mindestanforderungen genügt. Entscheidend ist dabei die Mitwirkung externer Gutachter sowohl aus der Fachwissenschaft als auch der Berufspraxis. Die Zertifizierung wird für einen begrenzten Zeitraum (5 bis 7 Jahre) ausgesprochen, danach ist eine Re-Akkreditierung erforderlich. Im Unterschied zur Akkreditierung sind bei der Reakkreditierung vor allem der Erfolg sowie die Studierbarkeit des Studiengangs sowie Evaluationsergebnisse entscheidend. Der zu reakkreditierende Studiengang wird an den Ergebnissen und dem Verlauf des Programms seit Abschluss des ersten Verfahrens gemessen - somit bietet sich die Chance, das Profil des Studiengangs zu schärfen und kontinuierlich  Studienbedingungen zu optimieren.

Die Umstellung auf die Bachelor- und Masterabschlüsse ist mit der erfolgreichen Akkreditierung aller Studiengänge der Ernst-Abbe-Fachhochschule Jena seit 2007 vollzogen. Mittlerweile ist ein Großteil der Studiengänge der Fachhochschule erfolgreich reakkreditiert, einige Studiengänge befinden sich noch im laufenden Reakkreditierungsverfahren. 

Die zentrale Begleitung aller (Re-)Akkreditierungsverfahren stellt sicher, dass Erfahrungen nicht nur bezogen auf einzelne Studiengänge gewonnen, sondern allen Studiengängen der Ernst-Abbe-Fachhochschule Jena zur Verfügung gestellt werden. Die Erkenntnisse aus den (Re-)Akkreditierungsverfahren fließen kontinuierlich in die Weiterentwicklung des Qualitätsmanagements ein und werden dokumentiert.